В этом сериале события разворачиваются на фоне сложных переплетений науки и политики. Главной героиней становится девушка-астрофизик, которая в 1967 году оказывается в сверхсекретной лаборатории во Внутренней Монголии. Она — дочь профессора, ставшего жертвой хунвэйбинов, что добавляет её жизни дополнительные сложности и конфликты. В стенах этой лаборатории разрабатываются технологии для отправки сигналов внеземным цивилизациям, что создает напряжённую атмосферу, пронизанную страхом и надеждой.
Параллельно в 2024 году мир сталкивается с парадоксами физики: ускорители частиц показывают данные, которые противоречат известным законам. В это время происходит череда загадочных самоубийств среди учёных. Лондонский детектив начинает расследование, сосредоточенное на учениках одной из погибших сотрудниц Оксфордского университета. Это обстоятельство бросает тень на исследования и вновь поднимает старые вопросы о том, что происходит с учеными.
В центре сюжета оказываются две студентки, каждая из которых играет свою роль в этом мрачном лабиринте. Одна из них занимается разработкой нановолокна и вскоре начинает видеть странные цифры обратного отсчета. Это предвестие чего-то глобального и тревожного, связывающего её с более масштабными событиями. Другая же, движимая жаждой понять причины трагедии своей подруги, находит у матери погибшей загадочный шлем виртуальной реальности.
Запустив видеоигру, где игроку предстоит спасти цивилизацию от гибели, она не осознает, что эта игра станет ключом к разгадке глубоких тайн — в том числе и той самой задачи трёх тел: трёх светил, вращающихся вокруг одной планеты. Каждый ход в игре может стать решающим как для персонажей виртуального мира, так и для их реальных прототипов.
В ходе повествования выстраивается связь между событиями прошлого и настоящим: жертвы коммунистического режима и современные научные достижения переплетаются в стремлении понять, как человечество может взаимодействовать с возможной внеземной жизнью. Параллельные линии времени создают напряжение и недоумение: так ли различны эти два мира или же они следуют одной и той же судьбе?
Каждый эпизод открывает новые аспекты существующего конфликта между знаниями и технологиями, а также морализирует о последствиях человеческого вмешательства в природу. Главные героини сталкиваются не только с внешними угрозами, но и с внутренними демонами своих амбиций и страха перед неизвестным. В конечном итоге оказывается, что ответы могут быть гораздо более запутанными, чем предполагалось изначально.